Maestria en Biología Molecular y Biotecnología

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    Caracterización reproductiva, análisis genómico de series de homocigosidad y genes asociados a desórdenes genéticos en ganado Blanco Orejinegro de Colombia
    (Pereira: Universidad Tecnológica de Pereira, 2020) Caivio Nasner, Sindy Liliana ; Rincón Flórez, Juan Carlos
    El ganado Blanco Orejinegro (BON) es un recurso criollo importante que cuenta con más de 500 años de adaptación al trópico montañoso de Colombia. Sin embargo, existe un desconocimiento de las bondades y la historia genética de la población . Por lo tanto, los objetivos de este estudio fueron i) Caracterizar el intervalo entre partos (IEP), edad al primer parto (EPP), número de partos máximo (NPmax) y duración de la gestación (DG) e identificar un modelo lineal que explique la variabilidad y los factores no genéticos asociados a cada característica, ii) Estimar par ́ametros y tendencias genéticas para IEP, EPP, DG y NPmax, iii) Estimar los niveles de desequilibrio de ligamiento (LD), el número efectivo (Ne), el coeficiente de endogamia genómico (F) por corridas de homocigosidad (FROH), matriz de relación genómica (FGRM), exceso de homocigotos (FHOM) e información del pedigrí completo e incompleto (FPEDCOMP, FPED) y caracterizar las series de homocigosidad (ROH) y iv) Determinar las frecuencias genotípicas para marcadores asociados a desórdenes genéticos, variantes de importancia en la producción y el color en el ganado BON...
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    Fenotipificación y genotipificación de la resistencia antimicrobiana de las bacterias gram negativas de mayor incidencia en pacientes oncológicos del eje cafetero
    (Pereira: Universidad tecnológica de Pereira, 2018) Pérez Machado, Luis Felipe ; Moncayo Ortiz, José Ignacio
    Las infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS) son las infecciones relacionadas a la atención en salud sin importar su contexto entre los cuales se encuentran los hospitales, centros de hospitalización e instalaciones comunitarias. Los pacientes oncológicos son más susceptibles a contraer IAAS, aumentando esta problemática en pacientes en estado crítico. Alrededor del 60% de las muertes de pacientes oncológicos se relacionan con IAAS. Por ello es importante la identificación, la prevención y la selección correcta de los tratamientos contra estas infecciones, teniendo en cuenta la resistencia antimicrobiana. El propósito de este estudio fue establecer y comparar la resistencia antimicrobiana genotípica y fenotípica de los aislamientos de bacterias Gram negativas más comunes causantes de IAAS en instituciones hospitalarias oncológicas del Eje Cafetero y contrastar estos resultados con el tratamiento empírico de los pacientes. Se realizó un estudio fenotípico que identificó los aislamientos y su resistencia por métodos automatizados y un estudio genotípico con un componente molecular que identificó genes de especie y genes de resistencia de 114 aislamientos de bacterias Gram negativas (Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae y Acinetobacter baumannii) aisladas de pacientes oncológicos del Eje Cafetero. Los especímenes clínicos fueron identificados por métodos microbiológicos automatizados en los centros médicos y por PCR en los laboratorios de microbiología de la Universidad Tecnológica de Pereira. La determinación genotípica de los genes de resistencia a β-lactámicos, carbapenémicos, sulfonamidas, quinolonas y aminoglucósidos fue determinada por PCR múltiple. Se elaboraron tablas de contingencia y se analizaron diferentes correlaciones entre la resistencia fenotípica, la resistencia genotípica y el tratamiento empírico de los pacientes.
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    Actividad neuprotectora de compuestos antioxidantes extraídos a partir de morera (Morus spp. L) en un modelo celular
    (Pereira: Universidad Tecnológica de Pereira, 2015) Zuluaga Vélez, Augusto
    Una de las principales evidencias en la Enfermedad de Parkinson es el estrés oxidativo provocado por las especies reactivas de oxígeno y nitrógeno, en las neuronas dopaminérgicas de la sustancia negra del sistema estriado. Debido a que en la actualidad no se ha podido controlar de forma satisfactoria este fenómeno, continuamente se desarrollan modelos animales y celulares con neurotoxinas cuyo objetivo es encontrar sustancias capaces de revertir, mitigar o prevenir las reacciones de oxidación en macromoléculas celulares. Es por esto, que se planteó en este estudio construir un modelo de la enfermedad de Parkinson empleando la línea celular SH-SY5Y y rotenona, el cual sirvió para evaluar el efecto de los compuestos antioxidantes extraídos a partir de variedades de morera (Morus spp L), en términos de reversión, mitigación y prevención del daño oxidativo. En este estudio se partió de 15 variedades del genero Morus de la familia Moraceae. Para cada muestra vegetal colectada se obtuvieron los extractos de metanol-agua y acetona-agua con los sistemas microondas y sonicación, a los cuales se les determinó la actividad antioxidante y la concentración de fenoles totales. Posteriormente, se seleccionaron algunos extractos para evaluar su efecto protector a nivel de ácidos nucleicos, lípidos, proteínas y viabilidad en línea celular SH-SY5Y. Los resultados mostraron que los extractos obtenidos por el método sonicación/acetona-agua tuvieron un efecto antioxidante capaz de inhibir y prevenir el deterioro oxidativo generado en la línea celular SH-SY5Y, cuando esta fue expuesta a concentraciones de rotenona 50 μM. Además, se evidenció una actividad protectora similar al resveratrol con extractos de las variedades Subong Pong, Ichinose y AA-2.
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    Detección de los genes que codifican superantígenos en staphylococcus aureus aislados de madres comunitarias del instituto colombiano de bienestar familiar de Pereira
    (Pereira: Universidad Tecnológica de Pereira, 2015) Flórez Restrepo, Gladys Fernanda
    La intoxicación alimentaria es un importante problema de salud pública a nivel mundial, en la intoxicación alimentaria muchos manipuladores de alimentos pueden ser portadores sanos de cepas de S. aureus en sus fosas nasales o en sus manos, estos son considerados como una de las principales fuentes de contaminación en alimentos, a través del contacto manual o mediante las secreciones respiratorias. El propósito del presente estudio fue detectar los genes que codifican los superantígenos en S. aureus aislados de madres comunitarias del Instituto Colombiano de Bienestar Familiar de Pereira (ICBF) Seccional Risaralda. Se tomaron 406 muestras en fosas nasales y manos de las madres comunitarias. El aislamiento se realizó por métodos microbiológicos y la confirmación por métodos microbiológicos y moleculares. Se obtuvieron 95 aislamientos de S. aureus. A los aislamientos se les determinó el perfil de susceptibilidad antimicrobiana por sistema microbiológico automatizado. La detección de los genes de enterotoxinas clásicas (SEA a SEE), toxinas exfoliativas (ETA y ETB) y la toxina del síndrome de choque tóxico – 1 (TSST-1), se realizó por medio de la reacción en cadena de la polimerasa única y/o múltiple.